mtx文件是按照稀疏矩陣格式存儲的矩陣數(shù)據(jù),可以按照以下步驟讀?。?/p>
pip install scanpy
import scanpy as sc adata = sc.read(filename) data = adata.X
第一行read之后返回的是annData,第二行通過.X操作得到的是矩陣數(shù)據(jù)
data = data.todense()
直接得到的矩陣是稀疏形式的,通過todense函數(shù)可轉(zhuǎn)換為稠密矩陣
補充:python讀取各種文件方式
use_time=[] with open(address,'r') as f: #ubuntu mobile = json.load(f) calls = mobile["transactions"][0]["calls"] for call in calls: use_time.append(str(call['use_time']))
rawdata1=open_workbook(address) rawdata=rawdata1.sheet_by_index(0) for i in range(1,rawdata.nrows): if rawdata.cell(i,date_index).value=="": #跳過空行 continue else: if ctype==3: #若為3,則用datetime模塊處理日期 date1=rawdata.cell(i,date_index).value date2 = xldate_as_tuple(date1,0) date3=datetime(*date2) if "." in str(rawdata.cell(i,phone_index).value): phone1=str(rawdata.cell(i,phone_index).value)[:-2] else: phone1=str(rawdata.cell(i,phone_index).value)
Excel_file = xlwt.Workbook() sheet = Excel_file.add_sheet('sheet0') header=[u'號碼','日期top1','日期top2','日期top3'] #寫入標(biāo)題行: for i in range(len(header)): sheet.write(0,i,header[i]) #開始按行寫入數(shù)據(jù): for i in range(len(phonelist)): sheet.write(i+1,0,phonelist[i]) sheet.write(i+1,1,dic[str(phonelist[i])]) #保存EXCEL: Excel_file.save("C:/Users/Desktop/100個文件輸出xls/"+str(fileName)+".xls")
rawdata=pd.read_csv(address,skip_blank_lines=True) #參數(shù)為去除空行 if 'start_time' or 'begin_time' in rawdata.columns: if 'start_time' in rawdata.columns: start_time=rawdata['start_time'] elif 'begin_time' in rawdata.columns: start_time=rawdata['begin_time']
rawdata=open(address,'r') i=0 a=[] #c存放第一行的列名 for line in rawdata: if i==1: #默認(rèn)第二行開始存儲通話數(shù)據(jù) a=line.split(',') #逗號作為分隔符 for j in range(len(a)): #查找指定列名所在的列下標(biāo) if (('-' in str(a[j]))or('/' in str(a[j]))): #判斷日期所在列數(shù) date_index=j #保存日期的列下標(biāo) elif str(a[j]).isdigit() and len(str(a[j]))>5: #默認(rèn)全為數(shù)字組成的字符串為電話號碼 phone_index=j else: pass break else: i+=1 i=0 for line in rawdata:#開始轉(zhuǎn)存數(shù)據(jù): if len(line)10: #跳過空行 continue data_line=line.split(',') #txt默認(rèn)以','分隔數(shù)據(jù) if i==0: pass #第一行為列名,跳過 i+=1 else: #從第二行開始保存數(shù)據(jù) start_time.append(data_line[date_index])
以上為個人經(jīng)驗,希望能給大家一個參考,也希望大家多多支持腳本之家。如有錯誤或未考慮完全的地方,望不吝賜教。
標(biāo)簽:陽泉 克拉瑪依 赤峰 金華 貴州 臨汾 雙鴨山 日照
巨人網(wǎng)絡(luò)通訊聲明:本文標(biāo)題《python如何讀取.mtx文件》,本文關(guān)鍵詞 python,如何,讀取,.mtx,文件,;如發(fā)現(xiàn)本文內(nèi)容存在版權(quán)問題,煩請?zhí)峁┫嚓P(guān)信息告之我們,我們將及時溝通與處理。本站內(nèi)容系統(tǒng)采集于網(wǎng)絡(luò),涉及言論、版權(quán)與本站無關(guān)。